2013年12月，由南京医科大学、首都医科大学、天津医科大学、哈尔滨医科大学、重庆医科大学、南方医科大学、第四军医大学七校研究生院负责人联合发起，后发起人加入中国医科大学。商定成立“全国医科院校（独立设置）研究生院联盟”。并就以下事项达成共识：
一、一致同意成立“全国独立设置医科大学研究生院联盟”， 一致通过《全国独立设置医科大学研究生院联盟章程（试行）》草案。联盟设常务委员会，常务委员会主任采取8校轮值制，秘书处设在南京医科大学研究生院，由张慎忠副院长任联盟秘书长。今后联盟的日常工作由秘书处负责。
二、联盟将依据章程，在自愿、平等、合作、发展的原则指导下，更好地贯彻国家教育方针，开展医学类研究生教育，提高研究生培养质量，为社会培养高素质医学人才；联盟将充分利用成员学校优质办学资源，建立互惠互利的合作关系，协同创新，提升各联盟成员的研究生教育质量、办学水平与社会声誉，从而实现联盟成员的可持续发展。
三、与会代表听取了上海“卓越”，北京“超星”两家公司MOOCs 平台介绍，为适应临床医学专业学位硕士生培养改革需要，联盟常委会决定与公司合作共建临床医学专业学位硕士研究生MOOCs 课程体系，由7校分别牵头建设1-2门核心课程，近期启动，力争年内建成。
